GTとマイコンを汎用通信で制御しようとしていますが、GTシリーズには通信モードが複数あり、どれを使用すべきかわかりません。

ＧＴシリーズには３つの通信モードがあります。
１．コマンド・レスポンスモード（通称：マイコン側が全ての主導権を持つモード）
２．双方向１モード（通称：無責任な垂れ流しモード）
３．双方向２モード（通称：上記１．２．の良い所取りモード）

お勧めは双方向２モードです。このモードではマイコン側が出す全てのコマンドに対し、ＧＴはレスポンスを返します。つまり双方向２モードはコマンドレスポンスモードの機能を全て持っています。さらに、ＧＴ側でスイッチが押されたり、データが入力されたりした場合、マイコン側からの読出しコマンドが来なくてもスイッチが押された瞬間にレスポンスを返信します。つまり、双方向２モードでは表示器が何らかの操作をされたかどうか判断するための定期的なポーリングが不要になります。

（コマンド・レスポンスモードでは定期的なポーリングが必要です。また、双方向１モードではマイコンからの書き込みコマンドに対しレスポンスが返信されないので、断線していたときの判断が不可能です。）