GTシリーズ：1台のPLCに２台のGTをGTリンクしています。片側の表示器を操作中、他方の操作はすべて無効になりますか？

すべてが無効になるわけではありません。
他方の表示器は、１つの操作を記憶し、占有状態が解除されたとき、その操作を実行します。
つまり、１つの操作は有効となります。