FP0R：FP0-A80（AFP0401）を使用しています。4ch中の1chのみ高速で入力を取り込みたいができますか？

できません。
このアナログユニットは使用するｃｈすべてを２ｃｈ単位で入力値をコントロールユニットに転送します。そのため、ある１ｃｈのみを高速に転送する事はできません。

※ＦＰ０Ｒアナログ入力ユニットも同様です。