FP∑でタイマやカウンタのSV値を保持させることは出来ますか？

SV値は保持するメモリエリアではありません。
保持を必要にするなら保持型のデータメモリＤＴを使ってＳＶへデータを書き込むプログラムを記述してください｡またFP∑の場合､メモリバックアップ電池がない場合は保持型のデータレジスタ55ワード:DT32710～DT32764に限られますのでご注意ください。