AFC8503をFP0のツールポートに接続している時は、問題なく動作するが、外すとFP0が動作しなくなる。

ＦＰ０の電源配線の方法が間違っているからです。

電源ケーブルの茶色線に２４Ｖ、緑色線に０Ｖを接続されると、

このような不具合が発生します。
正しくは、緑色線を外し、青色線に０Ｖを接続してください。

＜電源線の内容＞
茶色線：＋２４Ｖ
緑色線：アース（ＦＧ）
青色線：０Ｖ