タイマ接点（Ｔ）がカウンタ接点（Ｃ）に変わってしまい、（Ｔ）に戻そうとしても「命令入力が確定できません。」が表示される。

タイマ接点（Ｔ）がカウンタ接点（Ｃ）に変わってしまい、（Ｔ）に戻そうとしても「命令入力が確定できません。」が表示される。

PLCシステムレジスタ設定の「カウンタの開始Ｎｏ」を確認してください。
この値が変更されている可能性が高いです。
 正しい値に修正してください。